No dia 19 de dezembro de 1997, na Bolsa de Valores do Rio, o Consórcio Opportrans adquiriu o direito de explorar o serviço metroviário durante 20 anos, assumindo, em abril de 1998, o controle do serviço de transporte público metroviário.

Inicialmente, a concessionária tinha sob seu controle a administração e a operação do Metrô Rio, ficando as expansões da rede metroviária e aquisição de novos trens a cargo da Rio Trilhos (Governo do Estado). No final de dezembro de 2007, a concessão foi renovada até 2038 e o Metrô Rio assumiu a responsabilidade pela construção da Linha 1A, que ligará a linha 2 à Linha 1, acabando com a necessidade de transferência em Estácio, pela compra de 114 carros e construção das Estações Uruguai e Cidade Nova.

Os investimentos previstos aumentarão o número de pessoas atendidas diariamente pelo metrô dos atuais 550 mil clientes/dia para 1,1 milhão clientes/dia.

Desde 1999, o Metrô Rio realiza uma operação especial para o Réveillon carioca, com venda antecipada de bilhetes com horários pré-definidos, para garantir que todos cheguem à festa com tranquilidade, segurança e pontualidade.

A partir de 2000, o Metrô Rio estabeleceu diversas parcerias com o intuito de facilitar e baratear o transporte público da cidade. Em 2000, foi implantada a integração metrô-trem.
Em janeiro de 2002, foi inaugurada a linha de extensão Metrô Na Superfície que ligava a Estação Cardeal Arcoverde a Ipanema. Com a inauguração da Estação Siqueira Campos em março de 2003, a linha foi transferida para essa estação e passou também a atender aos bairros do Leblon e Gávea.

Em 2004, o Metrô Rio ofereceu diversas novidades para facilitar a vida de seus clientes: o início da operação aos domingos e a implementação das Linhas Expressas metrô-ônibus (12 linhas inauguradas entre 2004 e 2005).

O ano de 2007 foi marcado pela inauguração de uma nova estação na Zona Sul, a Cantagalo, e de duas novas linhas de extensão: o Metrô Na Superfície que liga a Estação Botafogo à Gávea, passando pelo Humaitá e Jardim Botânico, e o Metrô Barra, que liga a Estação Siqueira Campos à Barra, passando por Ipanema, Leblon e São Conrado.